中国科◣技网:我揭示SARS和新冠病毒在不同温度下与人类受体结合的差异性
科技日报记者 陈曦 通讯员 赵晖
记者2月24日从天津大学获悉,该校←生物信息中心主任高峰教授课题组通过分子动力学模拟,揭示了SARS冠状病毒和新冠病毒与人类受体在不同温度下结合特』性的差异,为药物设计提供有益的指々导和参考。该项研究2月22日∮在线发表在生物信息学领域顶尖期刊《生物信息学简报》上。
SARS病毒和新冠病毒对细胞的成功入侵,主要取决于刺突蛋㊣白(S蛋白)的受体结合域(RBD)与人类受体血管紧张素转化酶2(ACE2)之间的蛋白质-蛋白质相互№作用(相关结构如下图左所示)。
新冠疫情爆发以来,针对RBD与ACE2之间的相互⊙作用已进行了大量的研究,但绝大多数仅在室温300 K(约27摄氏度)下进行。温度是影响病毒感染性的重要因素,此次高峰教授课题组揭示了SARS病毒和新冠病毒在不同温度(200K, 250K, 273K, 300K, 350K)下,RBD和ACE2结合特性的差异。
高峰教授表示:“这项研究有助于了解SARS病毒和新冠病毒感染能力的差异。”
基于分子动力学模拟的平衡轨迹,高峰教授课题组发现,在所选取各温度下新冠病毒 RBD的均方根波动(RMSF)值都比SARS病毒低,构象分布更集〓中,说明新冠病毒 RBD结构更为稳定。
此外,SARS病毒/新冠病毒 RBD与ACE2在不同温度下的结≡合强度也通过分子力学和溶剂化相互作用能方法进行评估,发现在任意所选取温度下,新冠病毒RBD与ACE2的结合能力都比SARS病毒更强。随后对总结合自由▲能进行了残基分解,找到了RBD与ACE2结合过程中的热点残基(如上图右所示),与2020年《自然》报道▂的实验结果高度吻合。最后还重点分析了导致SARS病毒和新冠病毒两者RBD与ACE2结合差异的关键残基,为后续相关药物设计提供了有益的指导和参考。
责任编辑:何沛苁
(编辑 柴海凡)
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