生命学院宁康教授团队微生物亚种识别方法研究取得新进展
新闻网讯(通讯员 谭重阳)10月5日,牛津大学出版社(Oxford University Press)出版的《Bioinformatics》(2017年影◤响因子5.481)在线发表了生命学院宁康教授团队的微生物亚种识别方法Strain-GeMS(https://github.com/HUST-NingKang-Lab/straingems)。
生命学院宁康教授为通讯作者,生命学院硕士生谭重阳和南开大学讲师崔巍为共同第一作者。在已亚种鉴定方法ConStrains的基础上,该团队通过完成Multi-GeMS与SNP-flow, PAM等的整合,提供了一个更为准确的微生物亚种识别方法。在模拟数据上将Strain-GeMS与其他一些已有方法ConStrains,Midas,Sigma做了比较,验证了其亚种识别█的准确性。同时将Strain-GeMS应用到哈扎人肠道微生物数据上,揭示了亚种出现规律的季节性变化。
据了解,人类的许多疾病都与单个微生物或者一组微生物有关,如Ⅱ型糖尿病(T2D),肥胖症,癌症和一些免疫相≡关的疾病。同一物种内的不同菌株可能对人类健康产生完全不同的影响。例如,Escherichia coli O157:H7是一种高㊣毒力大肠杆菌菌株,而大肠杆菌中的大多数其他菌株不是致病的。将亚种识别应用到人体肠道和各种环境微生物群落的分析上,将会使我们对不同环境下的微生物亚种№存在情况,对亚种的地理分布、主导性与持续性产生全新的认识。通过对某些特定致病菌株的╳鉴定,还可以把亚种识别应用到流行病监测和医学诊断上,更好地服务于人类健康。
文章链接:https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/bty844/5116146?searchresult=1
未经允许不♂得转载:二九年华大学门户 » 生命学院宁康教授团队微生物亚种识别方法研究取得新进展
相关推荐
- 物理学◣院蔡建明教授团队观测到频域上的〓拉曼跃迁过程
- 【战疫·基层事记】一“网”情深筑平安——同济医学院四区网格员的故事
- 校领∑导走访校友谢伏瞻江金权
- 第一临床学院青年马克思主义者培养班学员交流会举行
- 【抗击新冠肺炎 华中大〒在行动】机械学院:精准帮扶离退休教职工
- 【战疫·基层事记】体育学院教职员工踊跃参与一线服务工作
- 【“长江学者”20年】生命学院刘剑峰教授:“骑士”的魔力●实验室
- “48H创客马→拉松”落幕
- 国家数字化设计与制造创新中心建设方案通@过专家论证
- 【抗击新冠肺炎 华中大在行△动】四学院同坚守网格十一战斗堡垒
- 缪小平教授团队在Cancer Research发文ξ 揭示中国人群结直肠癌易感位点
- 【整改进行时】材料学院安全整改见成效 警钟长鸣守初心
- 我校与重庆市政府签署全面战略合作协议
- 【抗击新冠肺炎 华中大在行动】华同总公司:全力以赴做好同济校区↘防疫后勤保障
- 管理学院开展冬季消防安全演习
- 诺贝尔奖获得者巴里·马歇尔教授》受聘我校荣誉教授
- 我校位居U.S.News全球最好大学排名内Ψ 地高校第九
- 【抗击新冠肺炎 华中大在行动】统一战线携手同心抗疫情(系列报道五)
- 新闻学子在重要学科竞赛中斩获佳绩
- 图书馆获中图学会“2019阅读推广星级单位ξ”荣誉称号
新闻公告
- 校团委研究部署疫情防控常态化背景下共青团重点工作 04-17
- 【战疫·基层事记】战“疫”,华中大应多一份思考 04-17
- 光电信息学院线上留学分享会助学子扬帆海外 04-16
- 《光明日报》连续刊发华中科技大学学者署名文章 04-16
- 百景园食堂学一食堂重新启动供餐服务 04-16
- “云”上课堂新举措 04-15
- 附中物理训练营正式启动 04-15
高考招生
- 华中科技大学2017年全日制普↓通本科招生章程 08-05
- 2018年华中科技大学全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2014年本科招∑ 生章程 08-05
- 华中科技大学2015年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2016年招生章程 08-05
- 华中科技大学2013全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2010年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2012年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2008年本科招生章程 08-05
- 华中科技大学2009年本科招生章程 08-05