高绍荣、张勇课题组破解生命初始▅的核小体重塑模式,相关研究成果发表于《细胞研究》
4月15日,生命科学与技术学院高绍荣教授与张勇课题组合作。《细胞研究》在线发表了题为《受精后核小体动态组织揭示小鼠合子基因组激活的调控因素》的文章。本文从核小体在第一染色质上的位置角度,揭示了小鼠受¤精后12小时◢内亲本染色质重组的动态过程和调控机制,强调了基于组蛋白的染色质状态调控对正常发育的意义,揭示了生命初始阶段的调控秘密。
对于哺乳动物等真核◣生物来说,DNA作ζ为遗传物质,需要缠绕在组蛋白中形成核小体,核小体是染色质的基本结构单位。核小体也是染色质的一级结构,是染色质后续凝集形成更复杂空结构的基础,也影响基因组上的转∞录活性。细胞内的染色体像古代文明中打结的音符一样记录和反映遗传信息,DNA分子像一条长绳,是信息记录的∏物质基础。核小体是绳子上最基本的结,是细胞内记录和传递遗※传信息的基本结构。它在不同类型的细胞中有不同的分布模式。精子发生过程中,核小体中的组蛋白被精子特有的→精蛋白取代,使染色↙质压缩在一起,呈高度凝集状态▂。在生命初期的受精过程中,这种高度压缩的染色质会解体,鱼精蛋白被组蛋白取∑代,一般状态下的核小体结构重新形成,从而完」成染色质重塑,为合子基因组激活(ZGA)创造基础。然而,长期以来,上述变化在基因组水平上是如何发展的,又是由哪些因素调控的,人们并不清楚。
“我们所做的是弄清楚如何解开配㊣ 子中打结的绳子,重新系上新的结,为传递遗传信息做准备。”高少荣↓介绍,但这个♀过程变化非常快,需要以小时为单位详细查△看。还需要区分不同来源的父母的基因组。更重要的是,要解决痕迹检测技术的问∮题。
研究团队开发了①一种新技术(ULI-MNase-seq,已获专利)在低︼起始量(甚至单细胞)下检测基因组核小体的排列,并开发了一套专门针对核小体数据的分☉析流程NEPTUNE。据高◆少荣介绍,利用显微操作,我们在受精后0.5小时至12小时连续9个时间点人工分离雌雄原核,检测这些原核和配子细胞的核小体排列,从而∴首次完成了受精前12小时核问题动态重塑的精细描述,发现受精后1小时左右即可完成亲本基因组中鱼精蛋白对组蛋白的▓替换,而雄性原核中与转╱录活性相关的核小体缺失卐区(核小体缺失区)。
图一。受精过程中核小体排列模式的建立
研究小组进一步探索了影响早期核小体排列的因∑ 素。发现DNA序列中的GC含量(鸟嘌呤与胞嘧啶之比)对核小体占用率有显著影响,组蛋白的乙酰化修饰可能对核小体NDR的形成有调节作用。此外,研究小组☆的分析发现,一些转录因子会在受精过程中逐渐取代核小体并与基▼因组的特定序列区域结合,并可能在更广泛的启动子区域参与核小体NDR的形成和特定基因的转▽录激活。研究人员分别敲除了Mlx和Rfx1两个〖转录因子,发现Mlx可以调节合子期的ZGA,而Rfx1可以显著影响2细胞期的ZGA。
2.转录因子影响核小体排列和ZGA
“我ω 们的研究首次绘制了小鼠雌、雄原核受精过程中核小体〓排列的高分辨率图谱,发现了核小体排列的模式,并预测了新的调控因子。受精过程中的▲核小体重排是探索生命初始阶段调控奥秘的○重要环节,不仅对发育生◣物学具有重要意义,对辅助生殖和人类生殖健康也具有重要意义。”高少荣介绍,这项研究为人们理解表观遗传修饰的代际传递和胚胎发育【过程中基因表达的调控提供了有力支持。
同济大学王、、、为论文第一作者,高绍荣、、为论文通讯作者々。这项研究得到了科技部、基金委员会和◤上海市科学技术委员会的支持。
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