我校研究团队在关联分析理论与应用研究领域取得新进展
南湖新闻网讯(通讯员 张亚雯)近日,我校植物科学技术学院统计基因组学团队在国际学术期刊Journal of Experimental Botany以“Evolutionary population structure model reveals pleiotropic effects of GmPDAT for seed oil- and size-related traits in soybean”为题发表了的最新研究成果。该研究提出了进化群体结构概念,发现了大豆种子油份含量与种子大小的多效基因GmPDAT,为大豆产量与品质育种提供了新方向。
群体结构是影响关联分析的重要因素。目前,它主要用每品种归属各亚群的后验概率Q矩阵和重要主成分得分矩阵来表示。研究发现,在作物野生▅材料、地方品种和育种品种组成的关联作图群体中,用其进化类型作为群体结构(简称进化群体结构),可发现一些新位点,例如,本研究在大豆第13号染色体上发现的与种子油份含量和种子大小相关的驯化位点。
在上述新位点附近,通过生物信ω 息学分析发现与大豆油脂代谢相关基因GmPDAT。它在野生大豆和栽培大豆亚群的等位基因频率存在显著差异,为驯化基因。该基因在大豆高油大粒品种的表达量显著高于低油小粒品种。
通过测定转GmPDAT基因T2代阳性株系、RNAi株系和野生型株系的种子油份含量和种子大小相关性状发现一是过表达株系的种子油份含量、亚油酸、亚麻酸、百粒重、粒长和粒宽显著高于野生型株系,二是RNAi株系的种子油份含量、亚油酸、亚麻酸、百粒重和粒厚显著低于野生型株系。
此外,结合三酰基甘油的连锁分析和转基因大豆种子细胞与油体大小比较,提出了GmPDAT通过增加三酰基甘油含量来控制大豆种子油份含量和种子大小的分子机制。这为多效和驯化基因鉴定提供了新思路。
我校植物科技学院博士研究生刘金洋和张亚雯为论文共同第一作者,章元明教授为论文通讯作者,中国农业科学院棉花研究所研究员商海红和美国农部研究员宋启建参与研究。本研究得到国家自然科学基金项目资助。
据悉,近年来,该团队提♂出了一系列多位点全基因组关联分析、连锁分析和BSA分析新方法,并从Monte Carlo模拟研究、真实数据分析、三维遗传网络构建和转基因实验验证四个方面论证了这些新方法的有效性,性能优于目前国际流行方法。团队在Molecular Plant、Briefings in Bioinformatics、Genomics, Proteomics & Bioinformatics等国内外刊物发表论文10余篇,主编Frontiers in Plant Science专辑1部,被收录于《生物信息学》(第二版)教材,被Nat Commun、Mol Plant和Plant J等动植物和林木遗传分析论文引用522次。
审核人:章元明
论文链接:https://academic.oup.com/jxb/advance-article/doi/10.1093/jxb/eraa426/5905248
未经允许不得转载:二九年华大学门户 » 我校研究团队在关联分析理论与应用研究领域取得新进展
相关推荐
- 李召虎赴广深两地调研并看望校友
- 动科动医学院:把温情融入每一名毕业生的记忆
- 郭刚奇为后保部班子及管理服务骨干上专题党课
- 李召虎率队赴神农架林区推进校地战略合作
- 校党政领导班子召开2020年第25次工▂作调度会
- 武汉理工大学程一兵教授来校交流
- 学校召开2020年定点扶贫工作会议
- 学校召开2020年思政教师座◥谈会
- 我校揭示植物调控细胞自噬和抗病途径新的分子机制
- 本科生院组织邮寄教材服务助力“停课不停学”
- 青春在奉献╳中绽放(三)
- “云赏狮山春”:领略落樱缤纷的唯美与浪漫
- 我校揭示油料作物Jojoba种子中蜡酯合成机制
- 徐强教授与新生描绘五彩斑斓的柑橘世界
- 学校领导到武金堤看望慰问巡查值守教职工
- 华中农业大学在玉米和水稻代谢组进化研究上获新进展
- 校党委常委会专题听取第二轮巡察工作汇报
- 2019年新聘正高级专业技术职务教师座谈会举行
- 理学院举行2019年度支部书记论坛
- 青春在奉献中绽放(一)
新闻公告
- 图书馆:以开放包容迎接“生命的萌新” 09-15
- 校党政领导班子召开2020年第26次工作调度会 09-15
- 武汉市长周先旺来校调研“扮靓江城迎国庆”工作 09-14
- 2020年秋季学期本科教学开课 09-14
- 唐尚书老师与新生共赏厚重的敦煌文化 09-14
- 彭贵青教授同新生分享与病毒的“不解之缘” 09-14
- 草坪音乐会:管弦和鸣,奏响浪漫大学 09-14
- 郭亮教授和新生漫谈“骑行之旅的成长与选择” 09-14
高考招生
- 2017年华中农业大学普通本科招生章程 08-05
- 2018年华中农业大学普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2015年全日制普通本科招ξ生章程 08-05
- 华中农业大学普通本科招生章程(2016年) 08-05
- 华中农业大学2013年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2014年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2012年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2008年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2009年全日制普通本科招生章程 08-05
- 华中农业大学2007年全日制普通本科招生章程 08-05