我校从全基因组角度揭示鳜鱼的凶猛食性机制
图1 翘嘴鳜捕★食活饵料鱼
图2 比较基因组学研究
南湖新闻网讯 (通讯员 何珊)近日,我校梁旭方教授课题组完成了鳜科4种鱼类的基因组测序工作,并在Nature旗下期刊Communications Biology上发表了题为“Mandarin fish (Sinipercidae) genomes provide insights into innate predatory feeding”的研究论文→。
鳜科(Sinipercidae)鱼类生性凶猛,自开食起即以其他鱼类为食,通常拒食浮游动物或人工饲料。适口活饵料鱼的稳定供应成为鳜鱼产业发展的关键制Ψ约因素,用人工饲料替代活鱼养鳜是产业健康可持续发展的必然选择。梁旭方教授↙课题组主导并与德国莱布尼茨淡水生态与内陆渔业研究所(IGB)合作完成了翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)基因组的三代测序及染色体水平组装,以及大眼鳜(Siniperca kneri)、斑鳜(Siniperca scherzeri)和少鳞鳜(Coreoperca whiteheadi)高质量「基因组组装。通过比较基因组学分析揭示了鳜科鱼类在凶猛食性、生长、幽门盲囊和盐度适应等性状上的㊣ 快速适应性进化机制。
鳃耙与鱼类食性密切相关,鳜科鱼类仅有4-9个鳃耙,少于其它鱼类。鳃耙发育相关基ω因edar低表达可能是翘嘴鳜鳃耙数目少的原因。Edar-/-鱼鳃耙缺失,对浮游动物的∞摄食减少,而对饵料鱼的摄食增加。EDAR激活剂能够促进鳃耙发育,更密的鳃耙有利于滤食浮游动物。bmp4高表达能够通过结合edar上游的Xvent-1位点抑制edar表达和鳃◆耙发育,从而使得鳜鱼更加凶猛。
我校何珊副教授、博士研※究生李玲和吕丽媛为论文共同第一作者,我校梁旭方教授和德国莱布尼茨淡水生态与内陆渔业研究所的Dr. Heiner Kuhl为论文通讯作者。该研究〇得到了国家特色淡水鱼产业技术体系-鳜营养需求与饲料(CARS-46)、德国科学基金会(DFG KU3596/1-1)、国家自然科学∑ 基金(31772822、31272641 和31602131)的资助。
论文链接:https://www.nature.com/articles/s42003-020-1094-y
审核人:梁旭方
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